时代背景
U．C．0088年2月22日，在地球圈发生了三股军事力量的大决战，其最终结果是提坦斯全军覆没，来自阿克西斯的新吉翁势力大伤元气，奥古取得了决定性的胜利。然而，动乱并未因此而结束。
2月24日，提坦斯一部分残存的势力组成以青年将校为核心的武装，以“新迪赛斯”(简称ND)之名发动叛乱。
3月23日，联邦军编成以计伐ND为任务的前卫舰队“阿尔法队”——a队。
3月28日，所罗门宙域的埃诺舰队反叛，与ND合成合流，其后数天攻击月面都市艾亚兹，至4月2日，月面守卫队及其所配置的试验型高达FAZZ被全灭。
4月5日，a队对ND发动特攻，完成任务，提坦斯之乱终结。
然而，不安定因素仍然存在，驻扎在小行行阿克西斯的哈曼·卡恩，此时正悄悄积蓄实力，准备向地球联邦及其部下发动进攻。这场将要发生的动乱，史上称为第一次新吉恩战争，亦即哈曼之乱。
STORY
0088年6月6日，新吉恩军向地球空降先遣部队，经两个月时间的活动，于8月1日正式发动对地救进攻。8月29日，新吉恩占领达卡尔，并将大量旧公国军及提坦斯残党收编。此后一发不可收拾，10月31日，新吉恩实施卫星坠落战术，终于迫使联邦于11月24日同意将殖民卫星群SIDE3让给新吉恩，以此作为吉恩从地球撤兵的条件。
然而，哈曼的文治武略无法令所有追随者认同。新吉恩旗下的年轻军官格雷米，在“独自振兴吉恩”信念驱使下于圣诞节反叛哈曼，率部从阿克西斯独立出来。
在这一系列重大变动造成的复杂局面中，代表联邦而战的军事组织奥古，在以布莱德为首的领导层指挥下，持续着艰苦卓绝的斗争。成为这—一时期奥古主力的战士，是以名叫捷多·五西塔的少年为首的一群来自殖民卫星的孩子，而捷多的座机，正是当年阿纳海姆社以卡缪为中心所进行开发的“Z”计划最后的作品——可变型机动战士MSZ——010“高达ZZ”捷多的恋人露·鲁卡则搭乘Z高达，其余同伴亦分别乘坐高达MK-II等机种。
与阿姆罗、卡缪一样，捷多也是一样强大的NEWTYPE，然而似乎也正因如此，同样难逃悲剧口口件的围绕：在战场上接触到的新吉恩NEWTYPE少女璞露，以及璞露的克隆体璞露2(读作“璞露茨”)，与捷多产生共鸣并消除敌意，但却又随之先后为保护捷多而丧生……
在露的激励下，捷多终于从沮丧中摆脱出来，同时，露亦创下击毙新吉恩叛军首领格雷米的战绩。终于，在O089年1月17日，以奥古为核心的联邦军，向阿克西斯发动了最后的进攻。
战斗如火如荼地展开了，为各自所相信的理想，信念而争个不休，同时进行着对决的捷多与哈曼，在一轮恶斗后，以哈曼·卡恩之死迎来了这场动乱的结束。
随着和平的曙光再次降临，捷多与露一起踏上了前往木星的旅途。对他们而言，出生入死的人生经历已经结束，新的生活正在前方招手。然而对于宇宙间多数平民百姓，真正的和平什么时候才能来到呢?